МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧНИЙ АНАЛІЗ РОСЛИН РОДУ CRAMBE, КУЛЬТИВОВАНИХ IN VIVO ТА IN VITRO (ID:923702)
Зміст
ВСТУП 4
РОЗДІЛ 1 ОГЛЯД ЛІТЕРАТУРИ 6
1.1. Характеристика генетичних маркерів 6
1.2. Види молекулярно-генетичних маркерів 10
1.3. Використання SSR- та ISSR-маркерів в генетичному аналізі рослин 12
1.4. Загальна характеристика об’єкта дослідження 17
1.5. Оцінка інформативності молекулярно-генетичних маркерів 19
РОЗДІЛ 2. МАТЕРІАЛИ ТА МЕТОДИ ДОСЛІДЖЕНЬ 22
2.1. Вихідний матеріал 22
2.2. Виділення рослинної ДНК 22
2.3. Спектрофотометричне вимірювання загальної рослинної ДНК 23
2.4. Полімеразна ланцюгова реакція 24
2.5. Фракціонування фрагментів ДНК 27
2.5. Біоінформатичний аналіз 29
РОЗДІЛ 3. РЕЗУЛЬТАТИ ТА ОБГОВОРЕННЯ 30
3.1. Визначення інформативності застосованих у дослідженні 30
SSR- та ISSR-маркерів 30
3.2. Дослідження філогенетичних зв’язків видів роду Crambe 44
ВИСНОВКИ 55
СПИСОК ВИКОРИСТАНИХ ДЖЕРЕЛ
Зразок роботи
Об’єктом дослідження було обрано 4 види рослин роду Crambe (катран), що занесені до Червоної книги України. Види катрану використовуються як кормові, овочеві, крохмальні, лікарські або медоносні рослини.
Перспективним напрямком вважається вирощування катрану як олійної культури. Тому доцільно випробовувати нові маркерні системи для проведення генетичного аналізу рослин роду Crambe.
Популяція в природних умовах потребує відповідного рівня генетичного різноманіття для виживання під тиском постійно мінливих біотичних і абіотичних компонентів екосистеми. На відміну від природних популяцій, рослини, культивовані in vitro, є генетично ідентичними нащадками однієї особини. Ізоляція клітин і перенесення в умови in vitro призводить до їхнього виходу з-під контролю організму, до складу якого вони входили раніше. Ці впливи є стресовими і спричинюють кардинальні перебудови функцій і метаболізму клітин, значне підвищення рівня геномної мінливості [2].
Рівень генетичного поліморфізму як природних популяцій, так і рослин, культивованих in vitro, найбільш ефективно визначається за допомогою ДНК-маркерів. Крім оцінки біорізноманіття, молекулярні маркери застосовуються для дослідження походження, доместикації видів і їх подальшої міграції, отримання інформації про філогенетичні зв’язки між видами, а також для географічної локалізації популяцій, що мають різне генетичне походження [3].
Метою роботи було дослідити генетичну різноманітність рослин роду Crambe, культивованих in vivo та in vitro, використовуючи ДНК- маркери.
Для досягнення цієї мети було поставлено такі завдання:
зробити аналіз сучасних літературних джерел, щоб виявити найраціональніші ДНК-маркери для аналізу зразків роду Crambe, культивованих in vivо та in vitro;
здійснити генетичний аналіз 4 видів роду Crambe за допомогою маркерних систем, що базуються на поліморфізмі міжмікросателітних послідовностей та власне мікросателітів;
оцінити міру інформативності обраних для роботи SSR- та ISSR-маркерів та визначити найоптимальніші з них за розрахунком показників інформативності ДНК-маркерів;
встановити філогенетичні зв’язки для досліджуваних зразків Crambe, культивованих in vivo та in vitro;
провести детальний аналіз отриманих результатів ДНК-профілей in vitro-зразків 4 видів Crambe з метою виявлення генетичних змін.
Інші роботи з даної категорії:
Магістр